prikaz prve stranice dokumenta Proteomska analiza uloge mistranslacije izoleucina u prilagodbi bakterije Escherichia coli na oksidacijski stres
  Preuzmi
PDF 2.26 MB
diplomski rad
Proteomska analiza uloge mistranslacije izoleucina u prilagodbi bakterije Escherichia coli na oksidacijski stres
2025. urn:nbn:hr:217:868059
Šerić, Mateo
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Kemijski odsjek

Citirajte ovaj rad

Šerić, M. (2025). Proteomska analiza uloge mistranslacije izoleucina u prilagodbi bakterije Escherichia coli na oksidacijski stres (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:868059

Šerić, Mateo. "Proteomska analiza uloge mistranslacije izoleucina u prilagodbi bakterije Escherichia coli na oksidacijski stres." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2025. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:868059

Šerić, Mateo. "Proteomska analiza uloge mistranslacije izoleucina u prilagodbi bakterije Escherichia coli na oksidacijski stres." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2025. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:868059

Šerić, M. (2025). 'Proteomska analiza uloge mistranslacije izoleucina u prilagodbi bakterije Escherichia coli na oksidacijski stres', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 19.03.2025., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:868059

Šerić M. Proteomska analiza uloge mistranslacije izoleucina u prilagodbi bakterije Escherichia coli na oksidacijski stres [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2025 [pristupljeno 19.03.2025.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:868059

M. Šerić, "Proteomska analiza uloge mistranslacije izoleucina u prilagodbi bakterije Escherichia coli na oksidacijski stres", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2025. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:868059

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:868059
Prijavite se u repozitorij kako biste mogli spremiti objekt u svoju listu.
Podaci o radu
NaslovProteomska analiza uloge mistranslacije izoleucina u prilagodbi bakterije Escherichia coli na oksidacijski stres
Naslov (engleski)Proteomic analysis of the role of isoleucine mistranslation in the adaptation of Escherichia coli to oxidative stress
AutorMateo Šerić
MentorJasmina Rokov Plavec (mentor)
MentorMarko Močibob (mentor)
Član povjerenstvaJasmina Rokov Plavec (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaŽeljka Car (član povjerenstva)
Član povjerenstvaIvana Kekez (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMorana Dulić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Kemijski odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2025-02-25, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Kemija
Sažetak
Točan prijenos genetičke informacije važan je za normalan rad bioloških sustava. Aminoacil- tRNA-sintetaze ključni su enzimi u prevođenju genetskog koda jer spajaju molekule tRNA s pripadnim aminokiselinama. Iako se ugradnja pogrešnih aminokiselina u proteine veže uz negativne posljedice, stanice od ovog procesa mogu imati pozitivne učinke, poput otpornosti na stresne uvjete. Soj bakterije Escherichia coli koji eksprimira izolecil-tRNA-sintetazu s nefunkcionalnom domenom za popravak pogreške... Više uzgajan je u mistranslatirajućim uvjetima, te je uočena prilagodba stanica na oksidacijski stres. Radi identifikacije procesa koji omogućuju ovu prilagodbu, izvršena je proteomska analiza. U stacionarnoj fazi utvrđeno je da mistranslacija na izoleucinskim položajima uzrokuje povećanu ekspresiju šaperona, proteaza te proteina koji sudjeluju u unosu peptida. Također, dolazi do smanjene ekspresije proteina koji sudjeluju u biosintezi enterobaktina, siderofora koji omogućuje transport željeza. Uočeno je i da dolazi do promjene u ekspresiji proteina koji sudjeluju u metabolizmu nekih aminokiselina. Dodatno, primijećena je pojačana ekspresija proteina RecA i smanjena ekspesija represora LexA, što upućuje da se aktivira SOS odgovor. Daljnja istraživanja pokazat će koji od ovih procesa su ključni za prilagodbu na oksidacijski stres uslijed mistranslacije. Sakrij dio sažetka
Sažetak (engleski)
Maintaining the accurate flow of genetic information is crucial for the normal function of all biological systems. Aminoacyl-tRNA synthetases are key enzymes in translating the genetic code, as they attach tRNA molecules to their cognate amino acids. Although incorporation of incorrect amino acids into proteins is generally associated with negative consequences, cells can sometimes benefit from this process, such as adaptation to stress. A strain of Escherichia coli expressing an... Više isoleucyl-tRNA synthetase with a nonfunctional editing domain was cultivated under various mistranslating conditions and adaptation to oxidative stress was observed. To identify biological processes responsible for this adaptation, a proteomic analysis was performed. Analysis of proteome in stationary phase revealed that mistranslation at isoleucine positions leads to increased expression of chaperones, proteases and proteins involved in peptide uptake processes. Additionally, a decrease in the expression proteins involved in biosynthesis of enterobactin, siderophore involved in iron transport. Changes in the expression of proteins that are involved in the metabolism of amino acids were found. Also, the upregulation of RecA and downregulation of LexA expression suggests activation of SOS response. Further research will point out which of these processes are key to adaptation to oxidative stress due to mistranslation. Sakrij dio sažetka
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:868059
Studijski programNaziv: Kemija; smjerovi: Istraživački
Smjer: Istraživački
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: sveučilišni/a magistar/magistra kemije (univ. mag. chem.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2025-03-19 12:33:10
accessibility

closePristupačnostrefresh

Ako želite spremiti trajne postavke, kliknite Spremi, ako ne - vaše će se postavke poništiti kad zatvorite preglednik.