Cilj ovog rada bio je utvrditi prisutnost virusa šarenila agruma (Citrus variegation virus, CVV) izravno iz uzoraka s terena i njegovu eventualnu rasprostranjenost u Hrvatskoj primjenom suvremenih laboratorijskih metoda utemeljenih na otkrivanju virusnog genoma. Pri tome su obuhvaćeni uzorci različitih tipova agruma, od komercijalnih nasada, obiteljskih vrtova do kolekcijskog nasada agruma Instituta za jadranske kulture i melioraciju krša u Splitu. Provedena molekularna detekcija CVV-a u uzorcima tkiva izravno s terena bila je prvo testiranje ove vrste kod nas te je bilo potrebno pronaći najprikladnije metode i optimizirati protokole. Za detekciju gena kapsidnog proteina CVVa primijenjena je molekularna metoda RT-PCR i IC/RT-PCR, dok su za izolaciju ukupnih nukleinskih kiselina primijenjene 2 metode, RNeasy Plant Mini Kit i izolacija prema protokolu Bennani i sur. (2002). Kao prihvatljiva i ekonomična metodologija za dokazivanje gena za kapsidni protein ovog virusa pokazao se postupak izolacije nukleinskih kiselina prema navedenom protokolu nakon kojeg slijedi RT-PCR. Elektroforetske analize amplikona provedene su uspješno u jeftinijem puferskom sustavu koji ima manji utjecaj na okoliš (Brody i Kern, 2004). Niti jedan testirani uzorak agruma nije pokazao prisutnost CVV-a primjenom navedene metodologije.