prikaz prve stranice dokumenta Interakcija proteina IqgC i Rab5A u amebi Dictyostelium discoideum
  Preuzmi
PDF 863.19 KB
diplomski rad
Interakcija proteina IqgC i Rab5A u amebi Dictyostelium discoideum
2022. urn:nbn:hr:217:122699
Ćutić, Tamara
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Citirajte ovaj rad

Ćutić, T. (2022). Interakcija proteina IqgC i Rab5A u amebi Dictyostelium discoideum (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:122699

Ćutić, Tamara. "Interakcija proteina IqgC i Rab5A u amebi Dictyostelium discoideum." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2022. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:122699

Ćutić, Tamara. "Interakcija proteina IqgC i Rab5A u amebi Dictyostelium discoideum." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2022. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:122699

Ćutić, T. (2022). 'Interakcija proteina IqgC i Rab5A u amebi Dictyostelium discoideum', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 16.04.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:122699

Ćutić T. Interakcija proteina IqgC i Rab5A u amebi Dictyostelium discoideum [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2022 [pristupljeno 16.04.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:122699

T. Ćutić, "Interakcija proteina IqgC i Rab5A u amebi Dictyostelium discoideum", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2022. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:122699

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:122699
Prijavite se u repozitorij kako biste mogli spremiti objekt u svoju listu.
Podaci o radu
NaslovInterakcija proteina IqgC i Rab5A u amebi Dictyostelium discoideum
Naslov (engleski)Interaction between Dictyostelium discoideum proteins IqgC and Rab5A
AutorTamara Ćutić
MentorVedrana Filić Mileta (mentor)
MentorIvana Ivančić Baće (sumentor)
Član povjerenstvaIvana Ivančić Baće (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaBiljana Balen (član povjerenstva)
Član povjerenstvaPetra Peharec Štefanić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMaja Matulić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2022-02-22, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Protein IqgC iz amebe Dictyostelium discoideum sudjeluje u makropinocitozi, neselektivnom unosu izvanstanične tekućine, kao negativni regulator proteina RasG. Protein RasG je mala GTPaza koju protein IqgC inaktivira poticanjem hidrolize vezanog GTP-a, odnosno IqgC djeluje kao njen GAP (engl. GTPase activating protein). Proteini IqgC i RasG su tijekom makropinocitoze smješteni na makropinocitotsku čašicu i novonastali makropinosom, ali IqgC ostaje na makropinosomu i nakon što je RasG disocirao. To sugerira da IqgC na makropinosomu zadržava interakcija s drugim proteinskim i/ili fosfolipidnim partnerom. Iz objavljenog interaktoma IqgC probrani su potencijalni proteini kandidati na temelju njihove uloge u sazrijevanju ranog makropinosoma te su preliminarni pokusi pokazali da se mala GTPaza Rab5A nalazi u kompleksu s IqgC. Cilj ovog rada bio je istražiti je li interakcija proteina IqgC i Rab5A izravna te usporediti prostorno-vremenske raspodjele ova dva proteina tijekom makropinocitoze. Metodom GST-pull-down potvrdili smo da se pročišćeni protein IqgC izravno veže na Rab5A. Koristeći konfokalnu mikroskopiju, pokazali smo da IqgC i Rab5A kolokaliziraju na makropinosomima, pri čemu IqgC disocira s vezikule znatno prije nego što Rab5A dosegne maksimalni intenzitet. Za razjašnjavanje fiziološke uloge ove interakcije potrebna su daljnja istraživanja.
Sažetak (engleski)
Dictyostelium discoideum IqgC protein interacts with the small GTPase RasG and promotes its GTP-hydrolytic activity, i.e. acts as its GAP (GTPase activating protein). By suppressing Ras activity, it negatively regulates macropinocytosis, the bulk uptake of extracellular fluid. During macropinocytosis, both IqgC and RasG localize to macropinocytic cup and newly formed macropinosome, but IqgC remains on the nascent macropinosome even after RasG dissociated. This suggests that another protein and/or phospholipid interactor engages with IqgC on the macropinosome. Few potential protein candidates have been selected from the published IqgC interactome, based on their known functions during early endosome maturation. Among them was the small GTPase Rab5A that was shown to exist in a complex with IqgC. In this work, we aimed to explore whether this interaction between IqgC and Rab5A is direct and to compare spatio-temporal distributions of these proteins during macropinocytosis. We performed a GSTRab5A-pull-down assay and confirmed that purified IqgC binds directly to Rab5A. Using confocal microscopy, we demonstrated colocalization of Rab5A and IqgC on macropinosomes with IqgC leaving the vesicle well before Rab5A reached maximal intensity. Deciphering the physiological significance of this interaction requires further investigation.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:122699
Studijski programNaziv: Molekularna biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra molekularne biologije (mag. biol. mol.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Datum isteka embarga: 2023-08-22
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2022-03-23 13:16:39