prikaz prve stranice dokumenta Model za izračun značajki peptida temeljen na sekvenci
Pristup korisnicima matične ustanove
završni rad
Model za izračun značajki peptida temeljen na sekvenci
2020. urn:nbn:hr:190:440301
Avsec, Petra
Sveučilište u Rijeci
Tehnički fakultet
Zavod za računarstvo
Katedra za programsku podršku

Citirajte ovaj rad

Avsec, P. (2020). Model za izračun značajki peptida temeljen na sekvenci (Završni rad). Rijeka: Sveučilište u Rijeci, Tehnički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:190:440301

Avsec, Petra. "Model za izračun značajki peptida temeljen na sekvenci." Završni rad, Sveučilište u Rijeci, Tehnički fakultet, 2020. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:190:440301

Avsec, Petra. "Model za izračun značajki peptida temeljen na sekvenci." Završni rad, Sveučilište u Rijeci, Tehnički fakultet, 2020. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:190:440301

Avsec, P. (2020). 'Model za izračun značajki peptida temeljen na sekvenci', Završni rad, Sveučilište u Rijeci, Tehnički fakultet, citirano: 10.04.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:190:440301

Avsec P. Model za izračun značajki peptida temeljen na sekvenci [Završni rad]. Rijeka: Sveučilište u Rijeci, Tehnički fakultet; 2020 [pristupljeno 10.04.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:190:440301

P. Avsec, "Model za izračun značajki peptida temeljen na sekvenci", Završni rad, Sveučilište u Rijeci, Tehnički fakultet, Rijeka, 2020. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:190:440301

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:190:440301
Prijavite se u repozitorij kako biste mogli spremiti objekt u svoju listu.
Podaci o radu
NaslovModel za izračun značajki peptida temeljen na sekvenci
Naslov (engleski)Feature computation model based on peptide sequence
AutorPetra Avsec
MentorGoran Mauša (mentor)
Član povjerenstvaKristijan Lenac (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaGoran Mauša (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Rijeci
Tehnički fakultet
(Zavod za računarstvo)
(Katedra za programsku podršku)
Rijeka
Datum i država obrane2020-09-16, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		TEHNIČKE ZNANOSTI
Računarstvo
Sažetak
U posljednje vrijeme velika se pažnja posve´cuje istraživanju peptida s antimikrobnom aktivnošću kako bi se našlo rješenje povećanoj otpornosti na antibiotike. U ovom radu stvoren je model za izračun značajki peptida od kojih neke imaju značajne uloge u antimikrobnim aktivnostima peptida i proteina. Modelu se mogu proslijediti podaci iz različitih izvora te on vraća vrijednosti svih izračunatih značajki spremljenih u datoteku csv formata. Značajke se računaju pomoću metoda dostupnih u modlAMP paketu koji je stvoren za rad s i analizu sekvenci prirodnih aminokiselina. U radu su prikazani isječci koda napisanog u Python programskom jeziku koji prikazuju kako su korištene funkcionalnosti modlAMP paketa te se analiziraju određeni podaci koji imaju značajnu ulogu u određivanju antimikrobnih aktivnosti peptida.
Sažetak (engleski)
Recently, much attention has been devoted to the study of peptides with antimicrobial activity in order to find a solution to increased antibiotic resistance. In this research, a model was created to calculate the features of peptides, some of which have significant roles in the antimicrobial activities of peptides and proteins. The model can receive data from different sources and it returns the values of all calculated features saved in a csv format file. Features are calculated using the methods available in the modlAMP package which was created to work with and analyze natural amino acid sequences. The paper presents snippets of code written in the Python programming language that show the usage of functionalities of the modlAMP package, and analyzes certain data that play a significant role in determining the antimicrobial activity of peptides.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:190:440301
Studijski programNaziv: Računarstvo
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: preddiplomski
Akademski / stručni naziv: sveučilišni/a prvostupnik/ prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) inženjer/inženjerka računarstva (univ. bacc. ing. comp)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaPristup korisnicima matične ustanove
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2021-09-29 07:19:45