prikaz prve stranice dokumenta Neki aspekti iterativnog pretraživanja proteoma
  Preuzmi
PDF 329.36 KB
diplomski rad
Neki aspekti iterativnog pretraživanja proteoma
2017. urn:nbn:hr:217:689253
Kobovac, Mihaela
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Matematički odsjek

Citirajte ovaj rad

Kobovac, M. (2017). Neki aspekti iterativnog pretraživanja proteoma (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:689253

Kobovac, Mihaela. "Neki aspekti iterativnog pretraživanja proteoma." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2017. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:689253

Kobovac, Mihaela. "Neki aspekti iterativnog pretraživanja proteoma." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2017. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:689253

Kobovac, M. (2017). 'Neki aspekti iterativnog pretraživanja proteoma', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 16.04.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:689253

Kobovac M. Neki aspekti iterativnog pretraživanja proteoma [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2017 [pristupljeno 16.04.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:689253

M. Kobovac, "Neki aspekti iterativnog pretraživanja proteoma", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2017. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:689253

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:689253
Prijavite se u repozitorij kako biste mogli spremiti objekt u svoju listu.
Podaci o radu
NaslovNeki aspekti iterativnog pretraživanja proteoma
AutorMihaela Kobovac
MentorPavle Goldstein (mentor)
Član povjerenstvaPavle Goldstein (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaMiljenko Huzak (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMladen Vuković (član povjerenstva)
Član povjerenstvaJosip Tambača (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Matematički odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2017-02-24, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Matematika
Sažetak
Opisali smo postupak traženja motiva iz neke proteinske familije u proteomu nekog organizma. Definirali smo ocjenu sličnosti bloka aminokiselina sa zadanim motivom te dobili da su maksimalne ocjene sličnosti, uz korekciju zbog nejednakih duljina nizova, logistički distribuirane. Pokusali smo ubrzati pretraživanje te smo poboljšali metodu alteracijom iterativnog građenja profila motiva. Analizom rezultata dobivenih traženjem GDSL enzima u proteomu biljke Arabidopsis thaliana pokazalo se da ova metoda daje vrlo dobre rezultate.
Sažetak (engleski)
We have described a procedure for iterative searching of protein motifs in a large set of protein sequences. We have described a similarity score in terms of a log-odds ratio, and established that the scores are following a logistic distribution. Furthermore, we have sped up the search procedure, and adjusted the profile building method. Analyses of results given by searching for GDSL enzymes in a protein of a plant Arabidopsis thaliana showed that our method gives very good results.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:689253
Studijski programNaziv: Matematička statistika
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra matematike (mag. math.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2017-04-26 11:15:28