prikaz prve stranice dokumenta Sklopovska implementacija postupaka za poravnanje genoma
Rad nije dostupan
diplomski rad
Sklopovska implementacija postupaka za poravnanje genoma
2014. urn:nbn:hr:168:808503
Polović, Marko
Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Citirajte ovaj rad

Polović, M. (2014). Sklopovska implementacija postupaka za poravnanje genoma (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:808503

Polović, Marko. "Sklopovska implementacija postupaka za poravnanje genoma." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2014. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:808503

Polović, Marko. "Sklopovska implementacija postupaka za poravnanje genoma." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2014. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:808503

Polović, M. (2014). 'Sklopovska implementacija postupaka za poravnanje genoma', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, citirano: 11.04.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:808503

Polović M. Sklopovska implementacija postupaka za poravnanje genoma [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva; 2014 [pristupljeno 11.04.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:808503

M. Polović, "Sklopovska implementacija postupaka za poravnanje genoma", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb, 2014. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:808503

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:808503
Prijavite se u repozitorij kako biste mogli spremiti objekt u svoju listu.
Podaci o radu
NaslovSklopovska implementacija postupaka za poravnanje genoma
Naslov (engleski)Hardware implementation of methods for genome alignment
AutorMarko Polović
MentorMladen Vučić (mentor)
Član povjerenstvaMladen Vučić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaDamir Seršić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMile Šikić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Zagreb
Datum i država obrane2014-07-17, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		TEHNIČKE ZNANOSTI
Računarstvo
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		TEHNIČKE ZNANOSTI
Elektrotehnika
Sažetak
Količine podataka koje se dobiju sekvenciranjem genoma prevelike su da bi njihovo poravnanje na današnjim računalima trajalo dovoljno kratko. Srećom, mnogi algoritmi za poravnanje se mogu paralelizirati te na taj način ubrzati. U ovom radu razvijen je sustav za poravnavanje koji se temelji na sklopovskoj realizaciji Needleman-Wunschevog algoritma. Sustav je implementiran na programabilnim logičkim poljima familije Virtex-6. Implementirano je 511 paralelnih procesnih elemenata koji povezani u linearno sistoličko polje računaju vrijednost poravnanja. Sustav za poravnanje se s računalom domaćinom povezuje pomoću PCI Express sučelja. Razvijeni sustav pokazuje da sklopovski pristup ima velik potencijal za ubrzavanje postupaka za poravnanje.
Sažetak (engleski)
The amount of data acquired by DNA sequencing is to big for acceptable duration of their alignment on today's computers. Fortunately, many algorithms for alignment can be parallelised thus increasing their execution speed. In this thesis, an alignment system is developed, which is based on hardware realization of the Needleman-Wunsch algorithm. The system is implemented on the field programmable gate arrays of the family Virtex-6. The system is implemented containing 511 processing elements which are connected in a linear systolic array. The alignment system is connected with the host computer via a PCI Express interface. The developed system indicates that hardware approach has a serious potential for the acceleration of alignment algorithms.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:168:808503
Studijski programNaziv: Elektrotehnika i informacijska tehnologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra inženjer/inženjerka elektrotehnike i informacijske tehnologije (mag. ing. el. techn. inf.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaZatvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Javna napomena
Datum i vrijeme pohrane2018-02-06 11:21:55